대학원 물리치료학과에는 각 교수들의 중점 연구 분야에 따라, 표면근전도 연구실, 운동분석 인체공학 연구실, 신경계 재활 및 운동조절 연구실, 운동 분석 인체공학 연구실, 응용운동학 연구실, 운동손상·스포츠 과학연구실, 장애 평가 도구 개발 연구실이 있으며, 서로 유기적으로 교육프로그램의 운영 및 연구 활동을 수행하고 있다. 양적 질적 측면 모두 국내 물리치료 학과 중 최고의 연구 성과를 가지고 있을 뿐 아니라 세계적 수준의 연구력을 보유하고 있다.

주요 연구 장비로는 삼차원 동작분석시스템, 표면근전도, 등속성 운동 측정장비, 초음파검사기기, 뇌파검사기기 등이 있다. 총 430명의 석사와 220명의 박사를 배출하였고 이 중 56명이 전국의 여러 대학에서 교수로 재직하며 물리치료 교육의 미래를 위해 일하고 있다. 2013년 1학기 현재 물리치료학과에서 소속된 대학원생은 석사 32 명, 박사 26명, 석박사 통합 2명이다.

(1)석사학위과정을 수료하기 위한 최저학점은 30학점으로 한다. 그 중 18학점은 본 학과에서 개설하는 과목으로 취득해야 하며, 나머지 학점은 주임교수의 승인 하에 타 학과에서 개설되는 과목으로 취득할 수 있다.

(2)박사학위과정을 수료하기 위한 최저학점은 30학점으로 한다. 그 중 18학점은 본 학과에서 개설하는 과목으로 취득해야 하며, 나머지 학점은 주임교수의 승인 하에 타 학과에서 개설되는 과목으로 취득할 수 있다. 단, 타 전공 석사학위 소지자가 박사과정에 입학한 경우 학과 교수회의의 결정에 따라 9학점 이내에서 보충과목을 이수토록 요구 할 수 있다(2011학년도 2학기 입학자부터 적용).

(3)석․박사통합과정을 통한 박사 학위취득에 필요한 최저학점은 54학점으로 한다. 그 중 36학점은 본 학과에서 개설하는 과목으로 취득해야 하며, 나머지 학점은 주임교수의 승인 하에 타 학과에서 개설되는 과목으로 취득할 수 있다(2011년 11월 추가됨, 입학연도와 무관하게 2012학년 1학기부터 적용).

(1) 석사학위과정
① 학위논문연구계획서 승인은 졸업하고자 하는 이전학기 말까지 교수회의에서 받아야 하며, 동시에 부심교수를 확정 받는다.

② 학위논문연구계획서 승인 시까지 연구논문을 1편 이상 국내외 저명학회지에 게재(또는 게재확정)해야 한다. 저자 수가 3인 이상인 경우에는 제1저자만 인정받으며, 저명학회지 여부는 본 학과 교수회의에서 정한다.

③ 외국 유명학술지 (SCI, SSCI, SCIE, MEDLINE) 에 제1저자 이고 교신저가 학과교수로 등록된 연구 논문 1편을 게재 혹은 게재확정시 학위논문으로 인정할 수 있다. 단, 해당논문을 규정된 학위논문 양식으로 바꾸어 제출해야 한다. (단, Case study나 종설은 영어시험 합격으로 인정 할 수 있으나 학위논문을 대체할 수 없다)

④ 학위논문연구계획서 전산입력은 졸업하고자 하는 학기 초에 주임교수의 결재를 득하여 학과 사무실에 제출한다.

(2) 박사과정 및 석․박사통합과정
① 학위논문 연구계획서 승인은 졸업하고자 하는 두 학기 전 기말까지 교수회의에서 받아야 하며, 동시에 부심교수를 확정 받는다.

② 박사과정: 학위논문 연구계획서 제출 전까지 연구논문을 2편 이상 국내외 저명학회지에 게재(또는 게재확정)해야 한다. 본인이 제1저자인 논문만 인정받으며, 저명학회지 여부는 본 학과 교수회의에서 정한다. 단, 석사학위 논문을 바꾸어 국내외 외국 유명학회지에 게재한 경우 박사학위취득을 위한 제 1저자 논문 편수에 포함 시킬 수 없다 (2011년 11월 개정, 입학 시점과 무관 하게 2012학년 1학기부터 적용).

③ 석․박사통합과정: 학위논문연구계획서 제출 전까지 연구논문을 3편 이상 국내외 저명학회지에 게재(또는 게재확정)해야 한다. 본인이 제1저자인 논문만 인정받으며, 저명학회지 여부는 본 학과 교수회의에서 정한다.(2012년 1학기 이후 석․박사통합과정으로 입학/또는 전환한 자부터 적용)

④ 박사 및 석․박사통합과정 공통: 외국 유명학술지 (SCI, SSCI, SCIE, MEDLINE) 에 제1저자 이고 교신저가 학과교수로 등록된 연구 논문 1편을 게재(혹은 게재확정)시 학위논문으로 인정할 수 있다. 단, 해당 논문을 규정된 학위논문 양식으로 바꾸어 제출해야 한다. (단, Case study나 종설은 영어시험 합격으로 인정 할 수 있으나 학위논문을 대체할 수 없다)

⑤ 학위논문 연구계획서 전산입력은 졸업하고자 하는 이전학기 초에 주임교수의 결재를 득하여 학과 사무실에 제출한다.

본 내규는 연세대학교 대학원 학칙에 명시되지 않은 사항들에 대한 규정이며, 따라서 대학원 학칙에 우선 할 수 없음.

(1) 외국어시험
① 석사학위과정은 외국어시험을 TOEFL 510점(CBT 180점, IBT 71점, TEPS 526점) 혹은 TOEIC 650점을 합격점수로 한다.

② 석․박사통합과정 및 박사학위과정의 외국어 합격점수는 TOEFL 530점(CBT 197점, IBT 80점, TEPS 577점) 혹은 TOEIC 700점으로 한다.

③ 학위과정 모두 외국 유명학술지 (SCI, SSCI, SCIE, MEDLINE)에 본인이 제 1 저자 이고, 교신저자는 학과교수로 등록된 논문이 게재 혹은 게재 확정되었을 경우, 외국어시험 합격으로 인정할 수 있다.

④ 석사학위 논문을 영어로 바꾸어 외국 유명학술지에 게재한 경우 박사학위취득을 위한 외국어 시험 합격으로 인정 할 수 없다. (2011년 11월 개정. 입학 시점과 무관하게 2012학년 1학기 부터 적용)

⑤ 전공교수회의에서 부득이하다고 인정되는 경우 자체시험을 실시할 수 있다. 합격점수는 100점 만점에 80점 이상으로 한다. 이 규정은 2008년 1학기 입학생 까지만 적용된다.

(2) 학위논문 제출 자격시험(종합시험)
① 응시자격
가. full time 학생은 2학기 이상 이수자, part-time 학생은 3학기 이상 이수한 자

나. 석사 및 박사 과정 은 21학점 이상, 석․박사통합과정은 45 학점 이상 취득한자 (석․박사통합과정에 대한 사항은 2011년 11월 개정됨, 입학년도와 무관하게 2011년 2학기부터 적용).

다. 외국어시험 합격을 학위논문 제출 자격시험 응시의 필수요건으로 하지 않는다.

② 응시절차
학위논문 제출 자격시험에 응시하고자 하는 학생은 소정기일 내에 응시원서 및 성적증명서 각 1통을 주임교수에게 제출하여 자격 승인을 받은 후 응시하여야 한다.

③ 수험료: 학위논문 제출 자격시험 응시자는 수험료를 학과에 납부하여야 한다.

④ 시험일자: 매년 7월초와 1월초에 실시한다.

⑤ 시험방법

가. 석사학위과정, 석․박사통합과정 및 박사학위과정의 학위논문 제출 자격시험은 필답시험으로 한다.

나. 석사학위과정 학생은 연구방법론, 물리치료학에 응시하여야 한다.

다. 박사학위과정 학생은 연구방법론, 재활학, 물리치료학에 응시하여야 한다.

⑥ 출제범위

가. 석사학위과정 : 전공영역과 연구 방법에 대한 기초 지식과 능력을 판정할 수 있는 문제를 출제한다.

나. 석․박사통합과정 및 박사학위과정 : 전공영역 전체의 전문적 연구 방법에 대한 넓고 깊은 지식 능력을 시험 한다. 다만, 개별 응시자의 전공영역을 감안하여 타 학과의 과목을 1과목 시험할 수 있다.

⑦ 합격인정점수
학위논문 제출 자격시험의 필답시험은 100점 만점에 평균 70점 이상을 합격으로 인정한다.

⑧ 재시험
학위논문 제출 자격시험 응시과목 중 낙제 과목이 있는 자는 담당교수 판단에 의하여 그 과목을 재 응시 하거나 다른 과목으로 대신할 수 있다.